公元2136年，一枚名為“哈米吉多頓”的小行星墜落地球，史稱“大災變”。一時間，天地變色，萬物蹉跎。人類文明分裂為兩支：以現代文明為基礎，苟延殘喘的“舊”人類，以及適應環境，投身自然的變異者，雙方隔閡重重，彼此征戰不休。
公元2236年，“大災變”一百年後，一位神秘女孩在人類東方定居點出現，她以軍方密探的身份，剷除一切有害於人類的敵人。與此同時，在東方定居點的貧民區，發生大規模屠殺居民的事件。這被認為是對政府權威的挑釁。軍方為之震怒。他們派出重兵，發誓要將敵人徹底清除。巨大的陰雲籠罩長江，恍惚間，一場暴風雨已經近在眼前。